Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L21D6R901 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L21D6R901 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP17L21D6R901 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms