Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
B4E1Z4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
B4E1Z4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
B4E1Z4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
B4E1Z4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
B4E1Z4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
B4E1Z4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
B4E1Z4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
B4E1Z4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
B4E1Z4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
B4E1Z4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
B4E1Z4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
B4E1Z4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
B4E1Z4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
B4E1Z4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
B4E1Z4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
B4E1Z4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
B4E1Z4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
B4E1Z4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
B4E1Z4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
B4E1Z4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
B4E1Z4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
B4E1Z4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
B4E1Z4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
B4E1Z4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
B4E1Z4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
B4E1Z4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
B4E1Z4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
B4E1Z4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
B4E1Z4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
B4E1Z4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
B4E1Z4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
B4E1Z4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
B4E1Z4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
B4E1Z4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
B4E1Z4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
B4E1Z4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
B4E1Z4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
B4E1Z4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
B4E1Z4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
B4E1Z4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
B4E1Z4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
B4E1Z4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
B4E1Z4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
B4E1Z4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
B4E1Z4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
B4E1Z4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
B4E1Z4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
B4E1Z4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
B4E1Z4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
B4E1Z4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
B4E1Z4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
B4E1Z4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
B4E1Z4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
B4E1Z4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
B4E1Z4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4E1Z4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4E1Z4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4E1Z4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4E1Z4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4E1Z4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4E1Z4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
B4E1Z4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4E1Z4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4E1Z4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4E1Z4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4E1Z4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4E1Z4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4E1Z4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4E1Z4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4E1Z4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4E1Z4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4E1Z4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4E1Z4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4E1Z4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4E1Z4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4E1Z4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4E1Z4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4E1Z4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4E1Z4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4E1Z4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4E1Z4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4E1Z4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4E1Z4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4E1Z4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4E1Z4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
B4E1Z4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4E1Z4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4E1Z4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4E1Z4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4E1Z4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4E1Z4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4E1Z4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4E1Z4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4E1Z4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4E1Z4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4E1Z4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
B4E1Z4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4E1Z4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4E1Z4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms