Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM1B2RUZ4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms