Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms