Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VGLL3A8MV65 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VGLL3A8MV65 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VGLL3A8MV65 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms