Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC85CA6NKD9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC85CA6NKD9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC85CA6NKD9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms