Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW4

LRRC3C, Leucine-rich repeat-containing protein 3C, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3CA6NJW4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC3CA6NJW4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC3CA6NJW4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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