Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP5A6NIR3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AGAP5A6NIR3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP5A6NIR3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms