Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC154A6NI56 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC154A6NI56 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms