Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA6BA6NDN3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOLGA6BA6NDN3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms