Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GMNCA6NCL1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms