Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWA3AA6NCI4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VWA3AA6NCI4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VWA3AA6NCI4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VWA3AA6NCI4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms