Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC66A2RUB6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC66A2RUB6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC66A2RUB6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms