Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIPSLA2A3N6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIPSLA2A3N6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms