Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA6A0AVT1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBA6A0AVT1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms