Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RQJ8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A0U1RQJ8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms