Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A0U1RQF3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A0U1RQF3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0U1RQF3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms