Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A087X1B8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A087X1B8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A087X1B8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A087X1B8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms