Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms