Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00312Q9Y6C7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms