Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHKBQ9Y259 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHKBQ9Y259 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms