Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RCE1Q9Y256 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RCE1Q9Y256 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RCE1Q9Y256 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RCE1Q9Y256 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RCE1Q9Y256 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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