Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms