Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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