Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms