Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CNTN3Q9P232 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms