Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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GDE1Q9NZC3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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GDE1Q9NZC3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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GDE1Q9NZC3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GDE1Q9NZC3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GDE1Q9NZC3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GDE1Q9NZC3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GDE1Q9NZC3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GDE1Q9NZC3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GDE1Q9NZC3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GDE1Q9NZC3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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