Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA2D2Q9NY47 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA2D2Q9NY47 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA2D2Q9NY47 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA2D2Q9NY47 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA2D2Q9NY47 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA2D2Q9NY47 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA2D2Q9NY47 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA2D2Q9NY47 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA2D2Q9NY47 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA2D2Q9NY47 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA2D2Q9NY47 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA2D2Q9NY47 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms