Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCM2LQ9NUG4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms