Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB6BQ9NRW1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms