Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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SNX15Q9NRS6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX15Q9NRS6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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