Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms