Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms