Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRDE2Q9H7Z3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms