Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM4Q9C037 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM4Q9C037 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms