Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIFKQ9BYG3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIFKQ9BYG3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms