Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF6Q9BYE7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms