Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COL25A1Q9BXS0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL25A1Q9BXS0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms