Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms