Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC9Q96Q05 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms