Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP47Q96K76 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP47Q96K76 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms