Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAF2Q96CS3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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