Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD2Q96BF3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms