Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RGMAQ96B86 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms