Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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RABGGTAQ92696 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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RABGGTAQ92696 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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RABGGTAQ92696 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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RABGGTAQ92696 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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RABGGTAQ92696 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGGTAQ92696 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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