Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TM9SF4Q92544 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms