Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRRN4Q8WUT4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms