Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEDD1Q8NHV4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD1Q8NHV4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms