Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTL3Q8N8U3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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