Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TMCO5AQ8N6Q1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TMCO5AQ8N6Q1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TMCO5AQ8N6Q1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TMCO5AQ8N6Q1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMCO5AQ8N6Q1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TMCO5AQ8N6Q1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCO5AQ8N6Q1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCO5AQ8N6Q1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMCO5AQ8N6Q1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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TMCO5AQ8N6Q1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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TMCO5AQ8N6Q1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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